Meiji döneminin ilk yıllarında geçen hikâyede Kenshin Himura, bir zamanlar “Hitokiri Battousai” adıyla korku salmış efsanevi bir suikastçıdır. Ancak savaşların ve dökülen kanın ardından geçmişini geride bırakmaya karar verir. Artık kimseyi öldürmemeye yemin etmiş, ters ağızlı kılıç taşıyan gezgin bir samuray olarak ülkeyi dolaşmaktadır.
Kenshin’in yolu Tokyo’da genç kılıç eğitmeni Kaoru Kamiya ile kesişir. Kaoru’nun dojosunda kalmaya başlayan Kenshin, zamanla yeni dostlar edinir; fakat geçmişteki düşmanları, eski savaşçılar ve Meiji döneminin karanlık yüzü onu rahat bırakmaz. Her karşılaşma, Kenshin’in hem koruma yeminini hem de içindeki eski Battousai kimliğini sınar.
